Emner: INF282 Bioinformatiske metoder I - Vår 2014

Studiepoeng

10.0

Undervisningsspråk

Engelsk

Undervisningssemester

Vår

Undervisningsstad

Bergen

Mål og innhald

Metodar for analyse av biologiske sekvensar og strukturar blir gjennomgått, blant anna metodar for oppdagaing og beskriving av fellestrekk (motiv), og korleis desse kan brukast til klassifisering. Andre tema relatert til genomanalyse og proteomikk kan også bli tatt opp, dette kan variere frå år til år.

Læringsutbyte

Etter fullført emne skal studenten kunne:

forklåre korleis log-odds scoringsmatriser (t.d. PAM, BLOSUM) er utvikla
lage program for å samanstille og å finne mønstre i ein familie av sekvensar og forklåre samanhengen med evolusjonære tre
forklåre korleis proteinstrukturar blir skildra og klassifisert, og lage program for å finne likskapar (mønstre) mellom to eller fleire strukturar
bruke kunnskap om bruk av massespektrometri i proteomikk til å utvikle program som er relevant i dette arbeidet
forstå korleis DNA-sekvensering kan brukast for å kartlegge genom og genuttrykk, og protein-DNA interaksjonar
forstå bruk av mikromatriser, sekvensering og proteomikk i funksjonell genomforsking, og kunne utvikle program for utvalde deloppgåver

Krav til forkunnskapar

Ingen

Tilrådde forkunnskapar

Byggjer på INF280, STAT101

Krav til studierett

For oppstart på emnet er det krav om ein studierett knytt til eit masterprogram/Ph.d-utdanninga ved Det matematisk-naturvitskaplege fakultet, samt at du oppfyller ev opptakskrav

Obligatorisk undervisningsaktivitet

Godkjente obligatoriske oppgåver.

Obligatoriske aktiviteter er gyldige i to semester, det semesteret aktiviteten godkjennes samt det påfølgende semesteret.

Vurderingsformer

Munnleg eksamen. Det er høve til munnleg midtvegseksamen og/eller å gje karakterar på oppgåver som kan inngå i sluttkarakteren.

Karakterskala

Ved sensur av emnet vert karakterskalaen A-F nytta.

Fagleg overlapp

I283: 10 SP

Vurderingssemester

Det er ordinær eksamen kvart semester

Emneevaluering

Studentane skal evaluere undervisninga i tråd med UiB og instituttet sitt kvalitetssikringssystem.

Kontaktinformasjon

Forelesar og Administrativ kontaktperson finn du på Mi side, kontakt ev studiekonsulenten på Insituttet.