Å erverva teoretisk og praktisk kunnskap om funksjonell og kvantitativ in vivo avbilding i menneske og dyr, ved bruk av magnetisk resonanstomografi (MRI) og datamaskin-basert biletanalyse. Hovudfokus er hjerne-avbilding (perfusjon, diffusjon permabilitetskartlegging, strukturell og funksjonell konnektivitet), men det vert også presentert eksempel frå funksjonell avbilding av nyre og (bilet-basert) systembiologi. Eit viktig mål er også å gi innsikt i kva tyding matematiske modellar og berekning innan analyse og forståing av komplekse fysiologiske prosessar har, og kva behov det er for tverrfagleg samarbeid.
Studentane vil verte i stand til å forklare dei fysiske prinsippa for MRI og funksjonell MR avbildning for undersøking / estimering av fysiologiske og morfologiske parametere (e.g. k-space og pulssekvenser, tensor estimering og eigenverdi-dekomposisjon, dekonvolusjon, kompartmentmodellering, statistisk modellering, og geometrisk modellering). Studentane vil og få praktisk kjennskap til programvare og algoritmer for kvantitativ analyse av bilet-basert informasjon i rom og tid, og vidare kunne installere og modifisere slike program for bruk i analyse og visualisering av eigne data. Denne kunnskapen er særskilt knytta til MATLAB og Python.
Etter fullført emne skal studenten kunne:
Vise kunnskapar om
Ferdigheiter og generell kompetanse
Førelesingar + programmeringslaboratorium og demonstrasjonar. Semester- og prosjektoppgåve. Kursmateriell inkl. lenkjer til programvare og data er tilgjengelig frå emnet si nettside.
A-F
Grunna utbrotet av COVID-19 (koronavirus) vil eksamen i vårsemesteret 2021 bli arrangert som heimeeksamen med karakterskala bestått/ikkje bestått
ELMED219 (2 ECTS)
HUFY372
Nettside:
http://sites.google.com/site/bmed360
Referansar:
Paul Tofts (Ed.) Quantitative MRI of the Brain: Measuring Changes Caused by Disease http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0470014296.html
Jirsa VK, McIntosh AR (Editors) Handbook of Brain Connectivity.
http://www.springerlink.com/content/978-3-540-71462-0 .
Gonzalez RC, Woods RE. Digital Image Processing, 3rd ed., Prentice Hall, 2008
http://www.imageprocessingplace.com
Gonzalez RC, Woods RE, Eddins SL. 2nd ed. Digital Image Processing Using MATLAB, Prentice Hall, 2009. http://www.imageprocessingplace.com
Skriftleg evaluering ved bruk av elektronisk evalueringsverkty.
Institutt for biomedisin
studie.biomed@uib.no
Emneansvarlig:
Arvid Lundervold: http://www.uib.no/personer/Arvid.Lundervold